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然后在医疗污水中，我们可以知道有许多病原微生物。消毒方法基本上可以分为两种，一种是物理方法，另一种是化学方法。
在化学方法中，使用各种化学物质，如臭氧消毒、氯消毒等来消毒污水，当然不同的消毒剂对病菌的灭活效果也不一样。
1、臭氧处理工艺。
臭氧处理属于化学方法处理，它是一种具有刺激性特殊气味的不稳定气体，在常温下臭氧是蓝色的，是现知的很强的氧化剂之一。
臭氧处理可以杀灭细菌繁殖体和芽胞、病毒、真菌等，并可破坏内毒杆菌毒素，是目前杀毒效果较好的处理工艺。经过臭氧的处理后，去污效果是比液氯消毒要好。但是运行的费用比较贵，并且臭氧处理工艺比较适合专门处理非典病人和疑似非典病人的医院以及各种专业传染病的医院废水处理。
2.氯消毒处理工艺。
液氯消毒是普遍的消毒剂，由于液氯的运行费用低，而且消毒效果比较稳定。
人们发现：一方面，氯气是一种有毒气体，因而在运输、使用过程中必须十分小心，防止氯气的泄漏；另一方面，用氯处理含有机物的废水，特别是含腐殖酸的水，能生成卤代烃(三卤甲烷，氯代烃等)，而这种物质对人体组织具有极大的破坏性并有致癌作用。除此之外，液氯消毒对某些病毒、芽孢无效。
采用液氯法消毒，随着时间的推移，水中病毒对氯化消毒产生较大的抗性。因此，目前在西方发达国家中，医疗废水的液氯处理正在逐步被二氧化氯或次氯酸钠所取代。
3.二氧化氯消毒。
二氧化氯消毒虽然也是氯消毒的一种，但是它只起到氧化作用，不起氯化作用。因此比液氯的效果要好，而且二氧化氯不与氨反应，在PH值6-10之中的杀菌效率基本不变。
所以二氧化氯的消毒能力是仅次于臭氧的，并且具备臭氧与紫外线的不具备的。
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